自考档案已经丢失那就只有补办了，为了不影响到后续例如考编政审、找工作，升学等，应该要立即补办。补办自考档案的流程如下：

拟写补办申请一份；

回自考毕业学校，找学校开具档案丢失证明；

将丢失证明、补办申请还有个人身份证件一起交给学校，确认核实以后给予补办；

补办好的档案盖公章和签字，重新密封。

自考档案补办好以后要合并到个人档案里，个人档案一般放在单位托管或者人才市场托管，记得及时的办理好。如果在办理档案补办的过程中遇到有不明白的地方可以咨询帮帮团档案代办机构，工作人员可以给出很好的建议，也可以帮助代为办理。